مدتی است که از دانشگاه آزاد اسلامی اخبار نگران کننده ای ناظر بر برخی ناکارآمدی ها و بی عدالتی ها در رسانه ها و شبکه های اجتماعی منتشر می شود؛ مجموعه تحولاتی که جدا از کارکنان، اساتید و دانشجویان این دانشگاه، صدای اعتراض برخی مقامات کشوری را نیز بلند کرده است. مثل سردار حسین دهقان مشاور رهبر معظم انقلاب که اخیراً گلایه های خود را در قالب نامه ای خطاب به دکتر علی اکبر ولایتی مکتوب کرده است.